Python (Jython) を使ってImageJ用のプログラミングを始めるために参考になるサイトのリンクです。なお、Jythonは、Python2.7ベースです。
sites.google.com 『ImageJではじめる生物画像解析』の著者三浦耕太氏による概説。
satoshithermophilus.hatenablog.com 最初にマクロの記録をPythonによって書き換える際、最初に参照したサイトです。とりあえず手っ取り早くPythonによるスクリプト書きをやるならこちら。
seesaawiki.jp プログラミングのための情報というよりはマニュアルの翻訳です。
ImageJ / FijiディストリビューションにおけるPython(Jython)プログラミングのチュートリアル。かなり高度なことまでカバーしています。
Python + ImageJ, Fiji Cookbook
多くの実用的な事例が載っています。
imagej.net ImageJの公式サイトで、どの程度Pythonでプログラミングが書けるかの案内です。チュートリアルではありません。事例が参考になります。
公式サイトにあるImageJ API一覧です。基本はJava用ですが、Python用に適宜読み替えて使用します。
imagej.netビルトイン・マクロ関数のレファレンスです。
jython.readthedocs.io ImageJではなく、Jython自体の解説です。日付は2010年になっていますがその後も細かく手が入っています。
sites.google.com『ImageJではじめる生物画像解析』のリンク集